本署為落實行政院「痛打毒品」、「斷絕毒源」政策，加強替代役役男在服役期間認識毒品危害、拒絕毒品，使其在服役期間發揮最大服務效能。除培訓替代役反毒種子協助反毒工作，成立替代役公益大使團進行反毒巡迴宣導外，更建置替代役役男尿液篩檢、毒品濫用預警與輔導機制，期以協助役男遠離危害、戒除毒品，健康服役。多年來致力於推動替代役反毒工作，深獲各界肯定，榮獲行政院110年反毒有功團體表揚。
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